Protein–RNA interactions for Protein: P41968

MC3R, Melanocortin receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC3RP41968 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MC3RP41968 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MC3RP41968 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MC3RP41968 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MC3RP41968 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MC3RP41968 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MC3RP41968 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MC3RP41968 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MC3RP41968 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MC3RP41968 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MC3RP41968 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MC3RP41968 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MC3RP41968 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MC3RP41968 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MC3RP41968 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MC3RP41968 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MC3RP41968 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MC3RP41968 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MC3RP41968 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MC3RP41968 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MC3RP41968 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MC3RP41968 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MC3RP41968 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MC3RP41968 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MC3RP41968 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MC3RP41968 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MC3RP41968 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MC3RP41968 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MC3RP41968 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MC3RP41968 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MC3RP41968 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MC3RP41968 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MC3RP41968 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MC3RP41968 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MC3RP41968 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MC3RP41968 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MC3RP41968 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MC3RP41968 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MC3RP41968 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MC3RP41968 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MC3RP41968 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MC3RP41968 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MC3RP41968 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MC3RP41968 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MC3RP41968 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MC3RP41968 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MC3RP41968 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MC3RP41968 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MC3RP41968 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MC3RP41968 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MC3RP41968 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MC3RP41968 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MC3RP41968 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MC3RP41968 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MC3RP41968 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MC3RP41968 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MC3RP41968 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MC3RP41968 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MC3RP41968 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MC3RP41968 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MC3RP41968 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MC3RP41968 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MC3RP41968 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MC3RP41968 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MC3RP41968 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MC3RP41968 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MC3RP41968 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MC3RP41968 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MC3RP41968 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MC3RP41968 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MC3RP41968 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MC3RP41968 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MC3RP41968 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MC3RP41968 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MC3RP41968 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MC3RP41968 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MC3RP41968 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MC3RP41968 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MC3RP41968 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MC3RP41968 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MC3RP41968 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MC3RP41968 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MC3RP41968 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MC3RP41968 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MC3RP41968 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MC3RP41968 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MC3RP41968 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MC3RP41968 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MC3RP41968 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MC3RP41968 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MC3RP41968 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MC3RP41968 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MC3RP41968 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MC3RP41968 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MC3RP41968 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MC3RP41968 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MC3RP41968 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MC3RP41968 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MC3RP41968 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MC3RP41968 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms