Protein–RNA interactions for Protein: P40938

RFC3, Replication factor C subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC3P40938 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC3P40938 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC3P40938 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC3P40938 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC3P40938 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC3P40938 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC3P40938 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC3P40938 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC3P40938 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC3P40938 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC3P40938 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC3P40938 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC3P40938 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC3P40938 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC3P40938 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC3P40938 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC3P40938 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC3P40938 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC3P40938 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC3P40938 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC3P40938 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC3P40938 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC3P40938 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC3P40938 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC3P40938 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC3P40938 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC3P40938 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC3P40938 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC3P40938 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC3P40938 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC3P40938 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC3P40938 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC3P40938 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC3P40938 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC3P40938 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC3P40938 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC3P40938 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RFC3P40938 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC3P40938 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC3P40938 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC3P40938 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC3P40938 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC3P40938 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC3P40938 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC3P40938 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC3P40938 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC3P40938 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC3P40938 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC3P40938 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC3P40938 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC3P40938 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC3P40938 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC3P40938 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFC3P40938 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFC3P40938 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFC3P40938 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFC3P40938 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFC3P40938 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFC3P40938 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFC3P40938 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFC3P40938 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFC3P40938 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFC3P40938 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFC3P40938 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC3P40938 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC3P40938 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC3P40938 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC3P40938 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC3P40938 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC3P40938 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC3P40938 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC3P40938 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC3P40938 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC3P40938 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC3P40938 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC3P40938 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC3P40938 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC3P40938 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC3P40938 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC3P40938 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC3P40938 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC3P40938 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC3P40938 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC3P40938 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC3P40938 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC3P40938 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC3P40938 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC3P40938 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC3P40938 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFC3P40938 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFC3P40938 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RFC3P40938 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFC3P40938 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFC3P40938 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFC3P40938 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RFC3P40938 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFC3P40938 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFC3P40938 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC3P40938 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RFC3P40938 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms