Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER4P35408 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER4P35408 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER4P35408 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTGER4P35408 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER4P35408 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER4P35408 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms