Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNNA1P35221 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNNA1P35221 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNNA1P35221 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNNA1P35221 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNNA1P35221 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTNNA1P35221 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTNNA1P35221 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTNNA1P35221 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTNNA1P35221 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTNNA1P35221 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTNNA1P35221 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTNNA1P35221 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTNNA1P35221 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CTNNA1P35221 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTNNA1P35221 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTNNA1P35221 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTNNA1P35221 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTNNA1P35221 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTNNA1P35221 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNA1P35221 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNA1P35221 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTNNA1P35221 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTNNA1P35221 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTNNA1P35221 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTNNA1P35221 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTNNA1P35221 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CTNNA1P35221 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTNNA1P35221 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTNNA1P35221 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNNA1P35221 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNNA1P35221 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTNNA1P35221 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTNNA1P35221 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTNNA1P35221 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNNA1P35221 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNNA1P35221 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNNA1P35221 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNNA1P35221 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNNA1P35221 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNNA1P35221 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNNA1P35221 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNNA1P35221 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNNA1P35221 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNNA1P35221 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNNA1P35221 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNA1P35221 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNA1P35221 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNA1P35221 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNNA1P35221 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNNA1P35221 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNNA1P35221 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNNA1P35221 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNNA1P35221 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CTNNA1P35221 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA1P35221 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA1P35221 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA1P35221 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA1P35221 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA1P35221 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA1P35221 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA1P35221 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA1P35221 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA1P35221 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNNA1P35221 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNNA1P35221 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNNA1P35221 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNNA1P35221 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNNA1P35221 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNA1P35221 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNA1P35221 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNA1P35221 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNA1P35221 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNA1P35221 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNA1P35221 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNNA1P35221 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNNA1P35221 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNNA1P35221 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNNA1P35221 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNNA1P35221 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNA1P35221 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNA1P35221 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNA1P35221 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNA1P35221 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNA1P35221 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNA1P35221 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNA1P35221 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNA1P35221 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTNNA1P35221 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CTNNA1P35221 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTNNA1P35221 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CTNNA1P35221 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CTNNA1P35221 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNNA1P35221 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNNA1P35221 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNNA1P35221 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNNA1P35221 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTNNA1P35221 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTNNA1P35221 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTNNA1P35221 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms