Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LSP1P33241 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LSP1P33241 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LSP1P33241 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LSP1P33241 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSP1P33241 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSP1P33241 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSP1P33241 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSP1P33241 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSP1P33241 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSP1P33241 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSP1P33241 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSP1P33241 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSP1P33241 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSP1P33241 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSP1P33241 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LSP1P33241 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LSP1P33241 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LSP1P33241 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LSP1P33241 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LSP1P33241 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSP1P33241 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSP1P33241 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSP1P33241 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSP1P33241 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSP1P33241 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSP1P33241 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSP1P33241 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSP1P33241 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSP1P33241 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSP1P33241 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSP1P33241 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSP1P33241 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LSP1P33241 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LSP1P33241 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LSP1P33241 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSP1P33241 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSP1P33241 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSP1P33241 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSP1P33241 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LSP1P33241 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LSP1P33241 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LSP1P33241 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSP1P33241 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSP1P33241 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSP1P33241 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSP1P33241 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSP1P33241 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSP1P33241 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSP1P33241 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSP1P33241 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSP1P33241 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSP1P33241 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSP1P33241 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LSP1P33241 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSP1P33241 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSP1P33241 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSP1P33241 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSP1P33241 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSP1P33241 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSP1P33241 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSP1P33241 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSP1P33241 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSP1P33241 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSP1P33241 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSP1P33241 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSP1P33241 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSP1P33241 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LSP1P33241 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LSP1P33241 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LSP1P33241 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LSP1P33241 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LSP1P33241 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSP1P33241 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSP1P33241 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSP1P33241 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSP1P33241 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSP1P33241 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSP1P33241 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSP1P33241 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSP1P33241 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSP1P33241 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSP1P33241 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSP1P33241 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSP1P33241 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSP1P33241 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSP1P33241 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSP1P33241 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSP1P33241 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSP1P33241 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSP1P33241 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LSP1P33241 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LSP1P33241 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSP1P33241 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LSP1P33241 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSP1P33241 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSP1P33241 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSP1P33241 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSP1P33241 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSP1P33241 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms