Protein–RNA interactions for Protein: P31350

RRM2, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM2P31350 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRM2P31350 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRM2P31350 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRM2P31350 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRM2P31350 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRM2P31350 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRM2P31350 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRM2P31350 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRM2P31350 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRM2P31350 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRM2P31350 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRM2P31350 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRM2P31350 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RRM2P31350 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRM2P31350 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRM2P31350 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRM2P31350 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRM2P31350 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRM2P31350 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRM2P31350 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM2P31350 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM2P31350 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM2P31350 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM2P31350 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM2P31350 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRM2P31350 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RRM2P31350 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRM2P31350 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RRM2P31350 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRM2P31350 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRM2P31350 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRM2P31350 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRM2P31350 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRM2P31350 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRM2P31350 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRM2P31350 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRM2P31350 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRM2P31350 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRM2P31350 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRM2P31350 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRM2P31350 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRM2P31350 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RRM2P31350 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRM2P31350 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRM2P31350 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RRM2P31350 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRM2P31350 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRM2P31350 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRM2P31350 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRM2P31350 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRM2P31350 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRM2P31350 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRM2P31350 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRM2P31350 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRM2P31350 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RRM2P31350 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RRM2P31350 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RRM2P31350 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRM2P31350 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RRM2P31350 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRM2P31350 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRM2P31350 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRM2P31350 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RRM2P31350 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRM2P31350 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRM2P31350 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRM2P31350 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM2P31350 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM2P31350 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM2P31350 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM2P31350 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM2P31350 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM2P31350 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM2P31350 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM2P31350 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRM2P31350 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRM2P31350 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRM2P31350 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRM2P31350 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRM2P31350 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRM2P31350 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRM2P31350 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRM2P31350 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRM2P31350 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRM2P31350 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRM2P31350 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRM2P31350 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRM2P31350 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRM2P31350 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRM2P31350 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRM2P31350 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRM2P31350 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRM2P31350 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRM2P31350 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRM2P31350 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RRM2P31350 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RRM2P31350 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RRM2P31350 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RRM2P31350 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RRM2P31350 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms