Protein–RNA interactions for Protein: P29558

RBMS1, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1P29558 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RBMS1P29558 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBMS1P29558 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBMS1P29558 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBMS1P29558 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBMS1P29558 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBMS1P29558 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBMS1P29558 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBMS1P29558 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBMS1P29558 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBMS1P29558 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RBMS1P29558 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBMS1P29558 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBMS1P29558 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBMS1P29558 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBMS1P29558 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RBMS1P29558 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBMS1P29558 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBMS1P29558 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBMS1P29558 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBMS1P29558 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBMS1P29558 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBMS1P29558 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBMS1P29558 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RBMS1P29558 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBMS1P29558 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBMS1P29558 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RBMS1P29558 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RBMS1P29558 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBMS1P29558 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBMS1P29558 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RBMS1P29558 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBMS1P29558 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms