Protein–RNA interactions for Protein: P28838

LAP3, Cytosol aminopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAP3P28838 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAP3P28838 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAP3P28838 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAP3P28838 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAP3P28838 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAP3P28838 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAP3P28838 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAP3P28838 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAP3P28838 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAP3P28838 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAP3P28838 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAP3P28838 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAP3P28838 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAP3P28838 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAP3P28838 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAP3P28838 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAP3P28838 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAP3P28838 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAP3P28838 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAP3P28838 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAP3P28838 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAP3P28838 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAP3P28838 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAP3P28838 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAP3P28838 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAP3P28838 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAP3P28838 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAP3P28838 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAP3P28838 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAP3P28838 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAP3P28838 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAP3P28838 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAP3P28838 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAP3P28838 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAP3P28838 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAP3P28838 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAP3P28838 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAP3P28838 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAP3P28838 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAP3P28838 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAP3P28838 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAP3P28838 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAP3P28838 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAP3P28838 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAP3P28838 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAP3P28838 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAP3P28838 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAP3P28838 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAP3P28838 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAP3P28838 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAP3P28838 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAP3P28838 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAP3P28838 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAP3P28838 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAP3P28838 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAP3P28838 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAP3P28838 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAP3P28838 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAP3P28838 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAP3P28838 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAP3P28838 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAP3P28838 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAP3P28838 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAP3P28838 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LAP3P28838 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAP3P28838 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAP3P28838 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LAP3P28838 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAP3P28838 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAP3P28838 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LAP3P28838 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAP3P28838 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAP3P28838 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAP3P28838 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LAP3P28838 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAP3P28838 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAP3P28838 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAP3P28838 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAP3P28838 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAP3P28838 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAP3P28838 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAP3P28838 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAP3P28838 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAP3P28838 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LAP3P28838 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LAP3P28838 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAP3P28838 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LAP3P28838 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAP3P28838 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAP3P28838 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAP3P28838 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAP3P28838 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAP3P28838 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAP3P28838 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAP3P28838 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAP3P28838 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAP3P28838 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAP3P28838 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAP3P28838 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAP3P28838 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms