Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC5P28715 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ERCC5P28715 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC5P28715 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERCC5P28715 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERCC5P28715 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC5P28715 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC5P28715 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC5P28715 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC5P28715 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC5P28715 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC5P28715 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERCC5P28715 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
ERCC5P28715 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC5P28715 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC5P28715 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC5P28715 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ERCC5P28715 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERCC5P28715 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC5P28715 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC5P28715 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERCC5P28715 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ERCC5P28715 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERCC5P28715 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC5P28715 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC5P28715 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC5P28715 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC5P28715 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC5P28715 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ERCC5P28715 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC5P28715 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC5P28715 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC5P28715 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC5P28715 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ERCC5P28715 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ERCC5P28715 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERCC5P28715 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERCC5P28715 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ERCC5P28715 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERCC5P28715 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC5P28715 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC5P28715 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC5P28715 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC5P28715 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC5P28715 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC5P28715 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC5P28715 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC5P28715 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC5P28715 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC5P28715 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC5P28715 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC5P28715 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC5P28715 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC5P28715 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC5P28715 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC5P28715 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC5P28715 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC5P28715 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERCC5P28715 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERCC5P28715 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERCC5P28715 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC5P28715 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC5P28715 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC5P28715 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC5P28715 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC5P28715 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC5P28715 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC5P28715 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERCC5P28715 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERCC5P28715 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERCC5P28715 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC5P28715 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC5P28715 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC5P28715 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC5P28715 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC5P28715 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC5P28715 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC5P28715 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC5P28715 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC5P28715 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC5P28715 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC5P28715 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC5P28715 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC5P28715 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC5P28715 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC5P28715 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC5P28715 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERCC5P28715 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC5P28715 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms