Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMOD1P28289 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMOD1P28289 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMOD1P28289 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TMOD1P28289 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMOD1P28289 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMOD1P28289 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMOD1P28289 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMOD1P28289 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD1P28289 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD1P28289 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD1P28289 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMOD1P28289 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMOD1P28289 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMOD1P28289 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMOD1P28289 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMOD1P28289 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMOD1P28289 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMOD1P28289 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMOD1P28289 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMOD1P28289 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMOD1P28289 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMOD1P28289 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMOD1P28289 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TMOD1P28289 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMOD1P28289 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMOD1P28289 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMOD1P28289 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMOD1P28289 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TMOD1P28289 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMOD1P28289 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMOD1P28289 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMOD1P28289 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMOD1P28289 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMOD1P28289 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMOD1P28289 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMOD1P28289 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD1P28289 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD1P28289 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD1P28289 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD1P28289 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMOD1P28289 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMOD1P28289 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMOD1P28289 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMOD1P28289 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TMOD1P28289 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMOD1P28289 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TMOD1P28289 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD1P28289 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD1P28289 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD1P28289 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD1P28289 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD1P28289 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD1P28289 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD1P28289 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD1P28289 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD1P28289 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD1P28289 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD1P28289 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD1P28289 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD1P28289 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD1P28289 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD1P28289 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMOD1P28289 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMOD1P28289 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMOD1P28289 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMOD1P28289 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD1P28289 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD1P28289 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD1P28289 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TMOD1P28289 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD1P28289 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD1P28289 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD1P28289 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD1P28289 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD1P28289 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD1P28289 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMOD1P28289 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMOD1P28289 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD1P28289 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD1P28289 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD1P28289 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD1P28289 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TMOD1P28289 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD1P28289 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD1P28289 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD1P28289 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMOD1P28289 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TMOD1P28289 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
TMOD1P28289 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TMOD1P28289 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMOD1P28289 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TMOD1P28289 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TMOD1P28289 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD1P28289 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD1P28289 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TMOD1P28289 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD1P28289 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD1P28289 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms