Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP11P24347 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP11P24347 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP11P24347 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP11P24347 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP11P24347 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP11P24347 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP11P24347 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP11P24347 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP11P24347 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP11P24347 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP11P24347 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP11P24347 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP11P24347 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP11P24347 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP11P24347 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP11P24347 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP11P24347 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP11P24347 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP11P24347 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP11P24347 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP11P24347 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP11P24347 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP11P24347 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP11P24347 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP11P24347 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP11P24347 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP11P24347 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP11P24347 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP11P24347 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP11P24347 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP11P24347 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP11P24347 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP11P24347 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP11P24347 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP11P24347 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP11P24347 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP11P24347 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP11P24347 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP11P24347 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP11P24347 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP11P24347 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP11P24347 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP11P24347 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP11P24347 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP11P24347 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP11P24347 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP11P24347 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP11P24347 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP11P24347 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MMP11P24347 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MMP11P24347 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP11P24347 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP11P24347 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP11P24347 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP11P24347 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP11P24347 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP11P24347 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP11P24347 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP11P24347 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP11P24347 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP11P24347 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP11P24347 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP11P24347 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP11P24347 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP11P24347 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP11P24347 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP11P24347 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP11P24347 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP11P24347 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP11P24347 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP11P24347 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP11P24347 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP11P24347 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP11P24347 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP11P24347 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP11P24347 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP11P24347 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP11P24347 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP11P24347 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP11P24347 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP11P24347 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP11P24347 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP11P24347 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP11P24347 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
MMP11P24347 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP11P24347 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP11P24347 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP11P24347 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP11P24347 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP11P24347 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP11P24347 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP11P24347 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP11P24347 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP11P24347 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP11P24347 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP11P24347 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP11P24347 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP11P24347 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP11P24347 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms