Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK11BP21127 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK11BP21127 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK11BP21127 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK11BP21127 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK11BP21127 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK11BP21127 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK11BP21127 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK11BP21127 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK11BP21127 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK11BP21127 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK11BP21127 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK11BP21127 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK11BP21127 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK11BP21127 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK11BP21127 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK11BP21127 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK11BP21127 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK11BP21127 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK11BP21127 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDK11BP21127 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDK11BP21127 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK11BP21127 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK11BP21127 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK11BP21127 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK11BP21127 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK11BP21127 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK11BP21127 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK11BP21127 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK11BP21127 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK11BP21127 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK11BP21127 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK11BP21127 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDK11BP21127 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDK11BP21127 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDK11BP21127 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK11BP21127 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK11BP21127 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK11BP21127 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK11BP21127 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK11BP21127 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms