Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMB1P20618 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB1P20618 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB1P20618 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB1P20618 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB1P20618 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB1P20618 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB1P20618 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB1P20618 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB1P20618 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB1P20618 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB1P20618 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB1P20618 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB1P20618 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB1P20618 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB1P20618 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB1P20618 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB1P20618 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB1P20618 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB1P20618 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB1P20618 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB1P20618 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB1P20618 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB1P20618 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB1P20618 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB1P20618 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB1P20618 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB1P20618 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB1P20618 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms