Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMY2BP19961 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMY2BP19961 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMY2BP19961 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMY2BP19961 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMY2BP19961 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMY2BP19961 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMY2BP19961 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMY2BP19961 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMY2BP19961 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AMY2BP19961 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AMY2BP19961 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AMY2BP19961 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AMY2BP19961 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AMY2BP19961 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AMY2BP19961 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AMY2BP19961 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AMY2BP19961 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AMY2BP19961 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AMY2BP19961 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AMY2BP19961 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AMY2BP19961 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AMY2BP19961 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMY2BP19961 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMY2BP19961 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
AMY2BP19961 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
AMY2BP19961 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMY2BP19961 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMY2BP19961 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AMY2BP19961 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMY2BP19961 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AMY2BP19961 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AMY2BP19961 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMY2BP19961 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMY2BP19961 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMY2BP19961 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMY2BP19961 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AMY2BP19961 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMY2BP19961 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMY2BP19961 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AMY2BP19961 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AMY2BP19961 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AMY2BP19961 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMY2BP19961 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMY2BP19961 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AMY2BP19961 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AMY2BP19961 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AMY2BP19961 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AMY2BP19961 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AMY2BP19961 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AMY2BP19961 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AMY2BP19961 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AMY2BP19961 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AMY2BP19961 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AMY2BP19961 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMY2BP19961 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMY2BP19961 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMY2BP19961 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMY2BP19961 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AMY2BP19961 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AMY2BP19961 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AMY2BP19961 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMY2BP19961 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 710.9 ms