Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCLP19338 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCLP19338 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCLP19338 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NCLP19338 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCLP19338 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCLP19338 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCLP19338 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCLP19338 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCLP19338 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCLP19338 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCLP19338 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCLP19338 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCLP19338 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NCLP19338 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCLP19338 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCLP19338 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCLP19338 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCLP19338 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCLP19338 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCLP19338 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCLP19338 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCLP19338 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCLP19338 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCLP19338 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCLP19338 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NCLP19338 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NCLP19338 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCLP19338 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCLP19338 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCLP19338 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCLP19338 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCLP19338 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCLP19338 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCLP19338 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCLP19338 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCLP19338 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCLP19338 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCLP19338 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCLP19338 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NCLP19338 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCLP19338 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCLP19338 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NCLP19338 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCLP19338 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCLP19338 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCLP19338 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCLP19338 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCLP19338 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCLP19338 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCLP19338 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCLP19338 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCLP19338 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCLP19338 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCLP19338 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCLP19338 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCLP19338 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NCLP19338 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCLP19338 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCLP19338 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCLP19338 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCLP19338 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCLP19338 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCLP19338 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCLP19338 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NCLP19338 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCLP19338 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCLP19338 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCLP19338 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCLP19338 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCLP19338 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCLP19338 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCLP19338 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCLP19338 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCLP19338 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCLP19338 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCLP19338 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCLP19338 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCLP19338 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCLP19338 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCLP19338 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCLP19338 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCLP19338 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NCLP19338 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCLP19338 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCLP19338 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCLP19338 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NCLP19338 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NCLP19338 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCLP19338 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCLP19338 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCLP19338 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCLP19338 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCLP19338 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCLP19338 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCLP19338 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NCLP19338 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCLP19338 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCLP19338 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCLP19338 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms