Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CKMT2P17540 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CKMT2P17540 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKMT2P17540 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKMT2P17540 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKMT2P17540 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKMT2P17540 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKMT2P17540 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKMT2P17540 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CKMT2P17540 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKMT2P17540 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKMT2P17540 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKMT2P17540 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CKMT2P17540 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKMT2P17540 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKMT2P17540 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKMT2P17540 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKMT2P17540 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKMT2P17540 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKMT2P17540 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKMT2P17540 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKMT2P17540 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKMT2P17540 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKMT2P17540 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKMT2P17540 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKMT2P17540 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CKMT2P17540 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKMT2P17540 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CKMT2P17540 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CKMT2P17540 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CKMT2P17540 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKMT2P17540 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms