Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME1P15531 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME1P15531 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME1P15531 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NME1P15531 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME1P15531 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME1P15531 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NME1P15531 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME1P15531 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME1P15531 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME1P15531 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NME1P15531 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NME1P15531 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME1P15531 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME1P15531 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME1P15531 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME1P15531 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME1P15531 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME1P15531 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME1P15531 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME1P15531 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME1P15531 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME1P15531 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME1P15531 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME1P15531 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME1P15531 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME1P15531 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME1P15531 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME1P15531 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME1P15531 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME1P15531 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME1P15531 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME1P15531 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME1P15531 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME1P15531 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME1P15531 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME1P15531 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NME1P15531 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME1P15531 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NME1P15531 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME1P15531 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME1P15531 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME1P15531 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME1P15531 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME1P15531 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME1P15531 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NME1P15531 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME1P15531 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME1P15531 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME1P15531 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME1P15531 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME1P15531 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME1P15531 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME1P15531 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME1P15531 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NME1P15531 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME1P15531 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NME1P15531 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME1P15531 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME1P15531 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME1P15531 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME1P15531 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME1P15531 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME1P15531 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME1P15531 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME1P15531 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NME1P15531 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME1P15531 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME1P15531 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME1P15531 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME1P15531 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NME1P15531 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME1P15531 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME1P15531 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME1P15531 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME1P15531 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME1P15531 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME1P15531 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME1P15531 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NME1P15531 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NME1P15531 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NME1P15531 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME1P15531 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME1P15531 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME1P15531 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME1P15531 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME1P15531 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME1P15531 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME1P15531 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME1P15531 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME1P15531 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME1P15531 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME1P15531 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NME1P15531 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME1P15531 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME1P15531 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME1P15531 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NME1P15531 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME1P15531 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME1P15531 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms