Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRAFP15056 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRAFP15056 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRAFP15056 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRAFP15056 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRAFP15056 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRAFP15056 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRAFP15056 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRAFP15056 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRAFP15056 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRAFP15056 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRAFP15056 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRAFP15056 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRAFP15056 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRAFP15056 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRAFP15056 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRAFP15056 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRAFP15056 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRAFP15056 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRAFP15056 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRAFP15056 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BRAFP15056 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRAFP15056 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRAFP15056 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRAFP15056 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRAFP15056 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRAFP15056 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRAFP15056 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRAFP15056 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BRAFP15056 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRAFP15056 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRAFP15056 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRAFP15056 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRAFP15056 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRAFP15056 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRAFP15056 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRAFP15056 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRAFP15056 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRAFP15056 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BRAFP15056 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRAFP15056 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRAFP15056 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRAFP15056 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRAFP15056 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRAFP15056 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRAFP15056 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRAFP15056 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BRAFP15056 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BRAFP15056 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BRAFP15056 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRAFP15056 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRAFP15056 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRAFP15056 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
BRAFP15056 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
BRAFP15056 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BRAFP15056 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BRAFP15056 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BRAFP15056 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRAFP15056 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRAFP15056 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRAFP15056 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRAFP15056 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRAFP15056 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRAFP15056 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRAFP15056 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRAFP15056 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRAFP15056 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRAFP15056 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRAFP15056 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRAFP15056 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRAFP15056 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRAFP15056 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRAFP15056 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRAFP15056 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRAFP15056 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRAFP15056 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRAFP15056 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRAFP15056 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRAFP15056 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRAFP15056 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRAFP15056 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRAFP15056 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRAFP15056 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRAFP15056 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRAFP15056 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRAFP15056 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRAFP15056 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRAFP15056 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRAFP15056 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRAFP15056 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRAFP15056 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BRAFP15056 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BRAFP15056 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BRAFP15056 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRAFP15056 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BRAFP15056 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRAFP15056 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRAFP15056 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRAFP15056 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRAFP15056 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms