Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC130P13994 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC130P13994 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC130P13994 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC130P13994 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC130P13994 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC130P13994 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC130P13994 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC130P13994 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC130P13994 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC130P13994 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC130P13994 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC130P13994 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC130P13994 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC130P13994 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC130P13994 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC130P13994 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC130P13994 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC130P13994 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC130P13994 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC130P13994 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC130P13994 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC130P13994 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC130P13994 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC130P13994 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC130P13994 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC130P13994 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC130P13994 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC130P13994 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC130P13994 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC130P13994 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC130P13994 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC130P13994 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC130P13994 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC130P13994 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC130P13994 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC130P13994 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC130P13994 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC130P13994 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC130P13994 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC130P13994 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC130P13994 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC130P13994 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC130P13994 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC130P13994 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC130P13994 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC130P13994 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC130P13994 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC130P13994 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC130P13994 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC130P13994 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC130P13994 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC130P13994 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC130P13994 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC130P13994 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC130P13994 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC130P13994 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC130P13994 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC130P13994 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC130P13994 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC130P13994 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC130P13994 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC130P13994 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC130P13994 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC130P13994 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC130P13994 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC130P13994 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC130P13994 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC130P13994 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms