Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTHFD1P11586 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTHFD1P11586 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTHFD1P11586 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTHFD1P11586 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTHFD1P11586 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTHFD1P11586 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MTHFD1P11586 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTHFD1P11586 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTHFD1P11586 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MTHFD1P11586 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTHFD1P11586 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTHFD1P11586 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTHFD1P11586 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTHFD1P11586 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTHFD1P11586 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTHFD1P11586 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTHFD1P11586 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTHFD1P11586 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTHFD1P11586 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTHFD1P11586 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTHFD1P11586 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTHFD1P11586 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTHFD1P11586 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTHFD1P11586 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTHFD1P11586 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTHFD1P11586 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTHFD1P11586 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTHFD1P11586 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MTHFD1P11586 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MTHFD1P11586 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTHFD1P11586 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTHFD1P11586 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTHFD1P11586 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTHFD1P11586 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTHFD1P11586 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTHFD1P11586 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTHFD1P11586 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms