Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRGAP2BP0DMP2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP2BP0DMP2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP2BP0DMP2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP2BP0DMP2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP2BP0DMP2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP2BP0DMP2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP2BP0DMP2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP2BP0DMP2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP2BP0DMP2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP2BP0DMP2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP2BP0DMP2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP2BP0DMP2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP2BP0DMP2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP2BP0DMP2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRGAP2BP0DMP2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP2BP0DMP2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP2BP0DMP2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP2BP0DMP2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP2BP0DMP2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP2BP0DMP2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRGAP2BP0DMP2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRGAP2BP0DMP2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRGAP2BP0DMP2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRGAP2BP0DMP2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRGAP2BP0DMP2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRGAP2BP0DMP2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRGAP2BP0DMP2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SRGAP2BP0DMP2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRGAP2BP0DMP2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRGAP2BP0DMP2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRGAP2BP0DMP2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SRGAP2BP0DMP2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRGAP2BP0DMP2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRGAP2BP0DMP2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRGAP2BP0DMP2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRGAP2BP0DMP2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP2BP0DMP2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP2BP0DMP2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP2BP0DMP2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP2BP0DMP2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SRGAP2BP0DMP2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SRGAP2BP0DMP2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRGAP2BP0DMP2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRGAP2BP0DMP2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms