Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM17P0DL12 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM17P0DL12 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM17P0DL12 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms