Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RGPD1P0DJD0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
RGPD1P0DJD0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RGPD1P0DJD0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RGPD1P0DJD0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RGPD1P0DJD0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RGPD1P0DJD0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RGPD1P0DJD0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RGPD1P0DJD0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RGPD1P0DJD0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.78■■■■□ 3
RGPD1P0DJD0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RGPD1P0DJD0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RGPD1P0DJD0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RGPD1P0DJD0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
RGPD1P0DJD0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RGPD1P0DJD0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.76■■■■□ 3
RGPD1P0DJD0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RGPD1P0DJD0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RGPD1P0DJD0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RGPD1P0DJD0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RGPD1P0DJD0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
RGPD1P0DJD0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RGPD1P0DJD0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RGPD1P0DJD0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RGPD1P0DJD0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
RGPD1P0DJD0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RGPD1P0DJD0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RGPD1P0DJD0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
RGPD1P0DJD0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RGPD1P0DJD0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RGPD1P0DJD0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RGPD1P0DJD0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RGPD1P0DJD0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RGPD1P0DJD0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
RGPD1P0DJD0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RGPD1P0DJD0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RGPD1P0DJD0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RGPD1P0DJD0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RGPD1P0DJD0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RGPD1P0DJD0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RGPD1P0DJD0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
RGPD1P0DJD0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RGPD1P0DJD0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RGPD1P0DJD0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RGPD1P0DJD0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RGPD1P0DJD0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RGPD1P0DJD0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
RGPD1P0DJD0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RGPD1P0DJD0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RGPD1P0DJD0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RGPD1P0DJD0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RGPD1P0DJD0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RGPD1P0DJD0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RGPD1P0DJD0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RGPD1P0DJD0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
RGPD1P0DJD0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RGPD1P0DJD0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RGPD1P0DJD0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RGPD1P0DJD0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
RGPD1P0DJD0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RGPD1P0DJD0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RGPD1P0DJD0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RGPD1P0DJD0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RGPD1P0DJD0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RGPD1P0DJD0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
RGPD1P0DJD0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
RGPD1P0DJD0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RGPD1P0DJD0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RGPD1P0DJD0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RGPD1P0DJD0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD1P0DJD0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD1P0DJD0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD1P0DJD0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD1P0DJD0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RGPD1P0DJD0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RGPD1P0DJD0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RGPD1P0DJD0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RGPD1P0DJD0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RGPD1P0DJD0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RGPD1P0DJD0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
RGPD1P0DJD0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RGPD1P0DJD0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RGPD1P0DJD0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
RGPD1P0DJD0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RGPD1P0DJD0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RGPD1P0DJD0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RGPD1P0DJD0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RGPD1P0DJD0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RGPD1P0DJD0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RGPD1P0DJD0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RGPD1P0DJD0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RGPD1P0DJD0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RGPD1P0DJD0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RGPD1P0DJD0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RGPD1P0DJD0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RGPD1P0DJD0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RGPD1P0DJD0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RGPD1P0DJD0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RGPD1P0DJD0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RGPD1P0DJD0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms