Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM228BP0C875 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM228BP0C875 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM228BP0C875 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM228BP0C875 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM228BP0C875 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM228BP0C875 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM228BP0C875 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM228BP0C875 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM228BP0C875 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM228BP0C875 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM228BP0C875 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM228BP0C875 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM228BP0C875 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM228BP0C875 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM228BP0C875 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM228BP0C875 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM228BP0C875 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM228BP0C875 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM228BP0C875 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM228BP0C875 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM228BP0C875 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM228BP0C875 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM228BP0C875 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM228BP0C875 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM228BP0C875 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM228BP0C875 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM228BP0C875 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM228BP0C875 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM228BP0C875 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM228BP0C875 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM228BP0C875 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM228BP0C875 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM228BP0C875 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM228BP0C875 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM228BP0C875 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM228BP0C875 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM228BP0C875 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM228BP0C875 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM228BP0C875 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM228BP0C875 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM228BP0C875 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM228BP0C875 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM228BP0C875 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM228BP0C875 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM228BP0C875 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM228BP0C875 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM228BP0C875 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM228BP0C875 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM228BP0C875 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM228BP0C875 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM228BP0C875 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM228BP0C875 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM228BP0C875 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM228BP0C875 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM228BP0C875 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM228BP0C875 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM228BP0C875 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM228BP0C875 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM228BP0C875 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM228BP0C875 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM228BP0C875 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM228BP0C875 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM228BP0C875 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FAM228BP0C875 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM228BP0C875 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM228BP0C875 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM228BP0C875 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM228BP0C875 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM228BP0C875 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM228BP0C875 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM228BP0C875 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM228BP0C875 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM228BP0C875 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM228BP0C875 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM228BP0C875 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM228BP0C875 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM228BP0C875 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM228BP0C875 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM228BP0C875 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM228BP0C875 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM228BP0C875 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM228BP0C875 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM228BP0C875 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM228BP0C875 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM228BP0C875 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM228BP0C875 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM228BP0C875 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM228BP0C875 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM228BP0C875 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM228BP0C875 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM228BP0C875 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM228BP0C875 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM228BP0C875 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM228BP0C875 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms