Protein–RNA interactions for Protein: P0C860

MSL3P1, Putative male-specific lethal-3 protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3P1P0C860 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSL3P1P0C860 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSL3P1P0C860 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSL3P1P0C860 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSL3P1P0C860 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSL3P1P0C860 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSL3P1P0C860 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSL3P1P0C860 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSL3P1P0C860 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSL3P1P0C860 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSL3P1P0C860 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSL3P1P0C860 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSL3P1P0C860 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSL3P1P0C860 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSL3P1P0C860 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSL3P1P0C860 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSL3P1P0C860 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSL3P1P0C860 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MSL3P1P0C860 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MSL3P1P0C860 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSL3P1P0C860 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSL3P1P0C860 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSL3P1P0C860 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSL3P1P0C860 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSL3P1P0C860 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSL3P1P0C860 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSL3P1P0C860 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MSL3P1P0C860 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MSL3P1P0C860 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSL3P1P0C860 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSL3P1P0C860 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSL3P1P0C860 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSL3P1P0C860 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSL3P1P0C860 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSL3P1P0C860 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MSL3P1P0C860 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MSL3P1P0C860 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MSL3P1P0C860 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSL3P1P0C860 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSL3P1P0C860 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSL3P1P0C860 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSL3P1P0C860 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSL3P1P0C860 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSL3P1P0C860 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MSL3P1P0C860 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSL3P1P0C860 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSL3P1P0C860 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MSL3P1P0C860 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MSL3P1P0C860 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MSL3P1P0C860 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MSL3P1P0C860 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MSL3P1P0C860 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MSL3P1P0C860 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSL3P1P0C860 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSL3P1P0C860 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSL3P1P0C860 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSL3P1P0C860 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSL3P1P0C860 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSL3P1P0C860 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSL3P1P0C860 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSL3P1P0C860 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSL3P1P0C860 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSL3P1P0C860 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSL3P1P0C860 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSL3P1P0C860 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSL3P1P0C860 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSL3P1P0C860 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSL3P1P0C860 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSL3P1P0C860 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSL3P1P0C860 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSL3P1P0C860 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms