Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRCP08575 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRCP08575 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRCP08575 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRCP08575 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRCP08575 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRCP08575 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRCP08575 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRCP08575 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRCP08575 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRCP08575 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRCP08575 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRCP08575 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPRCP08575 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPRCP08575 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPRCP08575 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPRCP08575 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRCP08575 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRCP08575 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRCP08575 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRCP08575 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPRCP08575 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRCP08575 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRCP08575 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRCP08575 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRCP08575 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRCP08575 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRCP08575 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
PTPRCP08575 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
PTPRCP08575 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PTPRCP08575 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRCP08575 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRCP08575 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTPRCP08575 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRCP08575 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRCP08575 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRCP08575 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRCP08575 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRCP08575 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRCP08575 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRCP08575 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRCP08575 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRCP08575 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRCP08575 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRCP08575 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRCP08575 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRCP08575 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPRCP08575 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRCP08575 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRCP08575 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRCP08575 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRCP08575 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRCP08575 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRCP08575 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRCP08575 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRCP08575 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRCP08575 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRCP08575 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRCP08575 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRCP08575 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRCP08575 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRCP08575 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRCP08575 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRCP08575 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRCP08575 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRCP08575 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRCP08575 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRCP08575 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRCP08575 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRCP08575 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRCP08575 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRCP08575 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRCP08575 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRCP08575 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRCP08575 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRCP08575 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRCP08575 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRCP08575 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRCP08575 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRCP08575 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRCP08575 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRCP08575 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRCP08575 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRCP08575 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRCP08575 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRCP08575 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRCP08575 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRCP08575 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRCP08575 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRCP08575 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRCP08575 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRCP08575 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRCP08575 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRCP08575 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRCP08575 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRCP08575 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRCP08575 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRCP08575 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRCP08575 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRCP08575 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
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