Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGB1P05556 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGB1P05556 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGB1P05556 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB1P05556 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB1P05556 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB1P05556 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB1P05556 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB1P05556 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB1P05556 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB1P05556 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB1P05556 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB1P05556 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB1P05556 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB1P05556 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB1P05556 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB1P05556 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB1P05556 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB1P05556 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGB1P05556 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGB1P05556 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGB1P05556 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB1P05556 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB1P05556 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB1P05556 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB1P05556 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB1P05556 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ITGB1P05556 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGB1P05556 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGB1P05556 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGB1P05556 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGB1P05556 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGB1P05556 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGB1P05556 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB1P05556 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB1P05556 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB1P05556 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB1P05556 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB1P05556 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB1P05556 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGB1P05556 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGB1P05556 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGB1P05556 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB1P05556 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB1P05556 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB1P05556 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB1P05556 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB1P05556 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB1P05556 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB1P05556 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB1P05556 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB1P05556 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB1P05556 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB1P05556 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB1P05556 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGB1P05556 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB1P05556 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ITGB1P05556 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB1P05556 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB1P05556 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB1P05556 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB1P05556 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB1P05556 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB1P05556 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB1P05556 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms