Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLR3DP05423 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
POLR3DP05423 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
POLR3DP05423 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
POLR3DP05423 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
POLR3DP05423 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
POLR3DP05423 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR3DP05423 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR3DP05423 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR3DP05423 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR3DP05423 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR3DP05423 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLR3DP05423 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLR3DP05423 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLR3DP05423 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLR3DP05423 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLR3DP05423 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR3DP05423 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR3DP05423 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR3DP05423 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLR3DP05423 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLR3DP05423 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLR3DP05423 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLR3DP05423 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLR3DP05423 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLR3DP05423 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLR3DP05423 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLR3DP05423 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
POLR3DP05423 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLR3DP05423 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
POLR3DP05423 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLR3DP05423 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLR3DP05423 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLR3DP05423 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR3DP05423 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR3DP05423 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR3DP05423 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR3DP05423 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR3DP05423 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR3DP05423 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR3DP05423 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLR3DP05423 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLR3DP05423 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLR3DP05423 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLR3DP05423 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
POLR3DP05423 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
POLR3DP05423 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
POLR3DP05423 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
POLR3DP05423 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
POLR3DP05423 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
POLR3DP05423 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
POLR3DP05423 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLR3DP05423 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLR3DP05423 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLR3DP05423 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLR3DP05423 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLR3DP05423 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLR3DP05423 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLR3DP05423 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLR3DP05423 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLR3DP05423 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLR3DP05423 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLR3DP05423 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLR3DP05423 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLR3DP05423 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLR3DP05423 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLR3DP05423 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLR3DP05423 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.5 ms