Protein–RNA interactions for Protein: P01782

IGHV3-9, Immunoglobulin heavy variable 3-9, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-9P01782 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-9P01782 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-9P01782 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-9P01782 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IGHV3-9P01782 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-9P01782 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-9P01782 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-9P01782 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-9P01782 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-9P01782 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-9P01782 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHV3-9P01782 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms