Protein–RNA interactions for Protein: P01133

EGF, Pro-epidermal growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFP01133 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EGFP01133 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EGFP01133 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EGFP01133 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EGFP01133 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EGFP01133 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EGFP01133 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EGFP01133 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EGFP01133 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EGFP01133 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EGFP01133 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EGFP01133 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EGFP01133 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EGFP01133 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EGFP01133 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
EGFP01133 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EGFP01133 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EGFP01133 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EGFP01133 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EGFP01133 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EGFP01133 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EGFP01133 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EGFP01133 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EGFP01133 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EGFP01133 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EGFP01133 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EGFP01133 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EGFP01133 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EGFP01133 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EGFP01133 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EGFP01133 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EGFP01133 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EGFP01133 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EGFP01133 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EGFP01133 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EGFP01133 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EGFP01133 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EGFP01133 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EGFP01133 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EGFP01133 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EGFP01133 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EGFP01133 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EGFP01133 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EGFP01133 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EGFP01133 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EGFP01133 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EGFP01133 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EGFP01133 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EGFP01133 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EGFP01133 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EGFP01133 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EGFP01133 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EGFP01133 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EGFP01133 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EGFP01133 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EGFP01133 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EGFP01133 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EGFP01133 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EGFP01133 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EGFP01133 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EGFP01133 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EGFP01133 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EGFP01133 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EGFP01133 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EGFP01133 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EGFP01133 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EGFP01133 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EGFP01133 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EGFP01133 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EGFP01133 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EGFP01133 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EGFP01133 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EGFP01133 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EGFP01133 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EGFP01133 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EGFP01133 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EGFP01133 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EGFP01133 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EGFP01133 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EGFP01133 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EGFP01133 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EGFP01133 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EGFP01133 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EGFP01133 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EGFP01133 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EGFP01133 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EGFP01133 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EGFP01133 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EGFP01133 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EGFP01133 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EGFP01133 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EGFP01133 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EGFP01133 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EGFP01133 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EGFP01133 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EGFP01133 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EGFP01133 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EGFP01133 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EGFP01133 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EGFP01133 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms