Protein–RNA interactions for Protein: O95744

PMS2P2, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P2O95744 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS2P2O95744 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS2P2O95744 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS2P2O95744 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS2P2O95744 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS2P2O95744 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS2P2O95744 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS2P2O95744 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P2O95744 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P2O95744 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P2O95744 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P2O95744 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P2O95744 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS2P2O95744 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS2P2O95744 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS2P2O95744 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS2P2O95744 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS2P2O95744 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS2P2O95744 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMS2P2O95744 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMS2P2O95744 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMS2P2O95744 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS2P2O95744 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS2P2O95744 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS2P2O95744 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS2P2O95744 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P2O95744 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P2O95744 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P2O95744 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS2P2O95744 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS2P2O95744 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS2P2O95744 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS2P2O95744 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS2P2O95744 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS2P2O95744 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS2P2O95744 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P2O95744 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P2O95744 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P2O95744 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P2O95744 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P2O95744 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PMS2P2O95744 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMS2P2O95744 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMS2P2O95744 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMS2P2O95744 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMS2P2O95744 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P2O95744 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P2O95744 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms