Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCELO95171 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCELO95171 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCELO95171 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCELO95171 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCELO95171 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCELO95171 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCELO95171 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCELO95171 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCELO95171 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCELO95171 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCELO95171 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCELO95171 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCELO95171 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCELO95171 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCELO95171 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCELO95171 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCELO95171 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCELO95171 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCELO95171 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCELO95171 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCELO95171 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCELO95171 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCELO95171 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCELO95171 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCELO95171 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCELO95171 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCELO95171 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCELO95171 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCELO95171 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCELO95171 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCELO95171 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCELO95171 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCELO95171 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCELO95171 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCELO95171 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCELO95171 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCELO95171 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCELO95171 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCELO95171 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCELO95171 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCELO95171 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCELO95171 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCELO95171 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCELO95171 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCELO95171 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SCELO95171 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SCELO95171 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCELO95171 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCELO95171 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCELO95171 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCELO95171 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCELO95171 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCELO95171 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCELO95171 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SCELO95171 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCELO95171 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCELO95171 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCELO95171 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCELO95171 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCELO95171 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCELO95171 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCELO95171 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCELO95171 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCELO95171 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCELO95171 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCELO95171 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCELO95171 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCELO95171 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCELO95171 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCELO95171 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCELO95171 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCELO95171 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCELO95171 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCELO95171 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCELO95171 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCELO95171 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCELO95171 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCELO95171 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCELO95171 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCELO95171 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCELO95171 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCELO95171 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCELO95171 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCELO95171 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCELO95171 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCELO95171 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCELO95171 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SCELO95171 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SCELO95171 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCELO95171 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCELO95171 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCELO95171 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCELO95171 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCELO95171 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCELO95171 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCELO95171 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SCELO95171 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCELO95171 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCELO95171 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms