Protein–RNA interactions for Protein: O94900

TOX, Thymocyte selection-associated high mobility group box protein TOX, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOXO94900 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOXO94900 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOXO94900 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOXO94900 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOXO94900 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOXO94900 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOXO94900 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOXO94900 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOXO94900 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOXO94900 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOXO94900 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOXO94900 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOXO94900 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOXO94900 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOXO94900 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOXO94900 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOXO94900 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOXO94900 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOXO94900 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOXO94900 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TOXO94900 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TOXO94900 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOXO94900 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOXO94900 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOXO94900 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOXO94900 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOXO94900 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOXO94900 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TOXO94900 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOXO94900 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TOXO94900 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOXO94900 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TOXO94900 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOXO94900 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOXO94900 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOXO94900 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOXO94900 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOXO94900 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TOXO94900 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOXO94900 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TOXO94900 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOXO94900 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOXO94900 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOXO94900 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TOXO94900 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOXO94900 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOXO94900 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOXO94900 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOXO94900 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOXO94900 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOXO94900 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOXO94900 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOXO94900 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOXO94900 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOXO94900 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOXO94900 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOXO94900 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOXO94900 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOXO94900 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOXO94900 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOXO94900 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOXO94900 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TOXO94900 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TOXO94900 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOXO94900 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOXO94900 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOXO94900 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOXO94900 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOXO94900 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOXO94900 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOXO94900 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOXO94900 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOXO94900 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOXO94900 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOXO94900 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOXO94900 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOXO94900 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOXO94900 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOXO94900 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOXO94900 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOXO94900 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOXO94900 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TOXO94900 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOXO94900 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOXO94900 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOXO94900 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOXO94900 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TOXO94900 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOXO94900 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOXO94900 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOXO94900 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOXO94900 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOXO94900 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOXO94900 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOXO94900 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOXO94900 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TOXO94900 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOXO94900 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TOXO94900 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOXO94900 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms