Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA10O75578 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA10O75578 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA10O75578 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA10O75578 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA10O75578 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA10O75578 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA10O75578 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA10O75578 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA10O75578 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA10O75578 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA10O75578 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA10O75578 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA10O75578 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA10O75578 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA10O75578 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA10O75578 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA10O75578 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA10O75578 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA10O75578 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA10O75578 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGA10O75578 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGA10O75578 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGA10O75578 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA10O75578 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITGA10O75578 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA10O75578 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA10O75578 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA10O75578 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA10O75578 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA10O75578 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA10O75578 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA10O75578 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA10O75578 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA10O75578 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA10O75578 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA10O75578 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA10O75578 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA10O75578 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA10O75578 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA10O75578 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA10O75578 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA10O75578 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA10O75578 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA10O75578 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA10O75578 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA10O75578 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms