Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKAP2O75563 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SKAP2O75563 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKAP2O75563 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKAP2O75563 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKAP2O75563 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKAP2O75563 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKAP2O75563 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKAP2O75563 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKAP2O75563 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKAP2O75563 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SKAP2O75563 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKAP2O75563 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKAP2O75563 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKAP2O75563 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKAP2O75563 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKAP2O75563 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SKAP2O75563 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKAP2O75563 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKAP2O75563 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKAP2O75563 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKAP2O75563 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKAP2O75563 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP2O75563 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP2O75563 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP2O75563 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP2O75563 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP2O75563 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP2O75563 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKAP2O75563 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKAP2O75563 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKAP2O75563 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SKAP2O75563 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms