Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MARCH6O60337 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MARCH6O60337 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MARCH6O60337 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MARCH6O60337 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MARCH6O60337 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MARCH6O60337 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MARCH6O60337 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MARCH6O60337 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MARCH6O60337 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MARCH6O60337 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MARCH6O60337 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MARCH6O60337 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MARCH6O60337 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MARCH6O60337 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MARCH6O60337 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MARCH6O60337 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MARCH6O60337 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MARCH6O60337 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MARCH6O60337 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MARCH6O60337 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MARCH6O60337 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MARCH6O60337 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MARCH6O60337 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MARCH6O60337 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MARCH6O60337 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MARCH6O60337 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MARCH6O60337 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MARCH6O60337 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MARCH6O60337 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MARCH6O60337 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MARCH6O60337 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MARCH6O60337 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MARCH6O60337 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MARCH6O60337 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MARCH6O60337 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MARCH6O60337 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MARCH6O60337 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MARCH6O60337 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MARCH6O60337 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MARCH6O60337 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MARCH6O60337 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MARCH6O60337 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MARCH6O60337 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MARCH6O60337 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MARCH6O60337 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MARCH6O60337 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MARCH6O60337 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MARCH6O60337 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MARCH6O60337 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MARCH6O60337 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MARCH6O60337 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MARCH6O60337 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MARCH6O60337 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MARCH6O60337 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MARCH6O60337 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MARCH6O60337 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MARCH6O60337 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MARCH6O60337 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MARCH6O60337 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MARCH6O60337 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MARCH6O60337 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MARCH6O60337 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MARCH6O60337 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MARCH6O60337 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MARCH6O60337 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MARCH6O60337 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MARCH6O60337 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MARCH6O60337 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MARCH6O60337 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms