Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TIMM44O43615 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TIMM44O43615 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TIMM44O43615 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TIMM44O43615 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TIMM44O43615 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TIMM44O43615 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TIMM44O43615 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TIMM44O43615 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TIMM44O43615 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TIMM44O43615 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TIMM44O43615 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TIMM44O43615 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TIMM44O43615 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TIMM44O43615 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TIMM44O43615 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TIMM44O43615 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TIMM44O43615 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TIMM44O43615 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TIMM44O43615 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TIMM44O43615 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TIMM44O43615 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TIMM44O43615 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TIMM44O43615 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TIMM44O43615 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TIMM44O43615 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TIMM44O43615 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TIMM44O43615 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIMM44O43615 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIMM44O43615 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIMM44O43615 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIMM44O43615 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIMM44O43615 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIMM44O43615 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIMM44O43615 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIMM44O43615 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TIMM44O43615 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TIMM44O43615 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TIMM44O43615 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TIMM44O43615 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TIMM44O43615 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TIMM44O43615 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TIMM44O43615 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TIMM44O43615 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TIMM44O43615 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TIMM44O43615 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TIMM44O43615 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TIMM44O43615 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TIMM44O43615 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TIMM44O43615 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TIMM44O43615 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TIMM44O43615 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TIMM44O43615 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms