Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
SYNJ1O43426 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC42.65■■■■■ 4.42
SYNJ1O43426 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
SYNJ1O43426 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
SYNJ1O43426 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
SYNJ1O43426 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
SYNJ1O43426 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
SYNJ1O43426 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC42.63■■■■■ 4.41
SYNJ1O43426 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.41
SYNJ1O43426 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.41
SYNJ1O43426 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.41
SYNJ1O43426 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.41
SYNJ1O43426 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
SYNJ1O43426 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
SYNJ1O43426 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
SYNJ1O43426 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
SYNJ1O43426 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
SYNJ1O43426 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
SYNJ1O43426 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC42.58■■■■■ 4.41
SYNJ1O43426 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
SYNJ1O43426 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC42.56■■■■■ 4.4
SYNJ1O43426 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
SYNJ1O43426 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
SYNJ1O43426 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC42.56■■■■■ 4.4
SYNJ1O43426 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
SYNJ1O43426 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
SYNJ1O43426 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
SYNJ1O43426 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
SYNJ1O43426 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
SYNJ1O43426 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
SYNJ1O43426 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
SYNJ1O43426 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
SYNJ1O43426 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
SYNJ1O43426 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
SYNJ1O43426 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
SYNJ1O43426 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
SYNJ1O43426 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
SYNJ1O43426 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
SYNJ1O43426 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC42.51■■■■■ 4.4
SYNJ1O43426 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
SYNJ1O43426 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC42.5■■■■■ 4.39
SYNJ1O43426 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
SYNJ1O43426 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
SYNJ1O43426 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
SYNJ1O43426 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
SYNJ1O43426 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
SYNJ1O43426 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
SYNJ1O43426 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
SYNJ1O43426 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
SYNJ1O43426 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
SYNJ1O43426 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
SYNJ1O43426 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
SYNJ1O43426 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
SYNJ1O43426 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
SYNJ1O43426 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
SYNJ1O43426 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC42.46■■■■■ 4.39
SYNJ1O43426 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
SYNJ1O43426 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
SYNJ1O43426 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC42.45■■■■■ 4.39
SYNJ1O43426 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
SYNJ1O43426 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
SYNJ1O43426 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
SYNJ1O43426 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC42.44■■■■■ 4.39
SYNJ1O43426 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.39
SYNJ1O43426 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.39
SYNJ1O43426 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
SYNJ1O43426 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
SYNJ1O43426 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC42.43■■■■■ 4.38
SYNJ1O43426 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
SYNJ1O43426 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
SYNJ1O43426 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
SYNJ1O43426 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
SYNJ1O43426 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
SYNJ1O43426 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
SYNJ1O43426 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC42.4■■■■■ 4.38
SYNJ1O43426 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
SYNJ1O43426 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
SYNJ1O43426 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
SYNJ1O43426 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
SYNJ1O43426 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC42.38■■■■■ 4.37
SYNJ1O43426 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
SYNJ1O43426 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
SYNJ1O43426 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
SYNJ1O43426 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
SYNJ1O43426 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC42.37■■■■■ 4.37
SYNJ1O43426 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC42.37■■■■■ 4.37
SYNJ1O43426 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
SYNJ1O43426 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
SYNJ1O43426 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
SYNJ1O43426 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC42.35■■■■■ 4.37
SYNJ1O43426 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
SYNJ1O43426 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
SYNJ1O43426 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
SYNJ1O43426 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
SYNJ1O43426 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
SYNJ1O43426 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
SYNJ1O43426 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC42.32■■■■■ 4.37
SYNJ1O43426 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
SYNJ1O43426 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
SYNJ1O43426 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.8 ms