Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMC8O43402 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMC8O43402 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMC8O43402 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMC8O43402 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMC8O43402 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMC8O43402 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMC8O43402 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMC8O43402 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMC8O43402 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMC8O43402 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMC8O43402 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMC8O43402 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMC8O43402 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMC8O43402 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMC8O43402 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMC8O43402 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMC8O43402 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMC8O43402 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMC8O43402 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMC8O43402 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMC8O43402 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMC8O43402 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMC8O43402 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMC8O43402 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMC8O43402 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMC8O43402 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMC8O43402 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMC8O43402 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMC8O43402 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EMC8O43402 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMC8O43402 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMC8O43402 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMC8O43402 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMC8O43402 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMC8O43402 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMC8O43402 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMC8O43402 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMC8O43402 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMC8O43402 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMC8O43402 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMC8O43402 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMC8O43402 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMC8O43402 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMC8O43402 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMC8O43402 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMC8O43402 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMC8O43402 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMC8O43402 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMC8O43402 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EMC8O43402 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMC8O43402 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMC8O43402 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMC8O43402 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMC8O43402 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMC8O43402 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMC8O43402 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EMC8O43402 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMC8O43402 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMC8O43402 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMC8O43402 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMC8O43402 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMC8O43402 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMC8O43402 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMC8O43402 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMC8O43402 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMC8O43402 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMC8O43402 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMC8O43402 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMC8O43402 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMC8O43402 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMC8O43402 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMC8O43402 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMC8O43402 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMC8O43402 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMC8O43402 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMC8O43402 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMC8O43402 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMC8O43402 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMC8O43402 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMC8O43402 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMC8O43402 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMC8O43402 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMC8O43402 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMC8O43402 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EMC8O43402 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EMC8O43402 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMC8O43402 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMC8O43402 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EMC8O43402 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMC8O43402 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMC8O43402 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EMC8O43402 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMC8O43402 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMC8O43402 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EMC8O43402 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMC8O43402 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMC8O43402 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMC8O43402 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMC8O43402 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1285 ms