Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD3O43242 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD3O43242 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD3O43242 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD3O43242 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD3O43242 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD3O43242 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD3O43242 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD3O43242 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD3O43242 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD3O43242 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD3O43242 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD3O43242 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD3O43242 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD3O43242 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMD3O43242 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD3O43242 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD3O43242 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD3O43242 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMD3O43242 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD3O43242 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMD3O43242 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD3O43242 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMD3O43242 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD3O43242 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD3O43242 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD3O43242 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD3O43242 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD3O43242 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD3O43242 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMD3O43242 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD3O43242 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD3O43242 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD3O43242 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD3O43242 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD3O43242 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMD3O43242 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD3O43242 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD3O43242 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD3O43242 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMD3O43242 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PSMD3O43242 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMD3O43242 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms