Protein–RNA interactions for Protein: O15540

FABP7, Fatty acid-binding protein, brain, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FABP7O15540 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FABP7O15540 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FABP7O15540 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FABP7O15540 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FABP7O15540 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FABP7O15540 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FABP7O15540 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FABP7O15540 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FABP7O15540 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FABP7O15540 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FABP7O15540 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FABP7O15540 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FABP7O15540 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FABP7O15540 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FABP7O15540 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FABP7O15540 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FABP7O15540 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FABP7O15540 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FABP7O15540 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FABP7O15540 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FABP7O15540 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FABP7O15540 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FABP7O15540 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FABP7O15540 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FABP7O15540 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FABP7O15540 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FABP7O15540 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FABP7O15540 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FABP7O15540 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FABP7O15540 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FABP7O15540 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FABP7O15540 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FABP7O15540 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FABP7O15540 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FABP7O15540 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FABP7O15540 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FABP7O15540 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FABP7O15540 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FABP7O15540 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FABP7O15540 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FABP7O15540 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FABP7O15540 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FABP7O15540 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FABP7O15540 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FABP7O15540 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FABP7O15540 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FABP7O15540 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FABP7O15540 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FABP7O15540 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FABP7O15540 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FABP7O15540 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FABP7O15540 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FABP7O15540 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FABP7O15540 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FABP7O15540 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FABP7O15540 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FABP7O15540 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FABP7O15540 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FABP7O15540 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FABP7O15540 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FABP7O15540 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FABP7O15540 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FABP7O15540 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FABP7O15540 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FABP7O15540 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FABP7O15540 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FABP7O15540 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FABP7O15540 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FABP7O15540 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FABP7O15540 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FABP7O15540 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FABP7O15540 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FABP7O15540 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FABP7O15540 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FABP7O15540 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FABP7O15540 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FABP7O15540 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FABP7O15540 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FABP7O15540 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FABP7O15540 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FABP7O15540 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FABP7O15540 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FABP7O15540 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FABP7O15540 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FABP7O15540 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FABP7O15540 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FABP7O15540 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FABP7O15540 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FABP7O15540 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FABP7O15540 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FABP7O15540 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FABP7O15540 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FABP7O15540 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FABP7O15540 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FABP7O15540 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FABP7O15540 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FABP7O15540 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FABP7O15540 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FABP7O15540 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FABP7O15540 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms