Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPTLC1O15269 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPTLC1O15269 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPTLC1O15269 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
SPTLC1O15269 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
SPTLC1O15269 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPTLC1O15269 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPTLC1O15269 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPTLC1O15269 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPTLC1O15269 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPTLC1O15269 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPTLC1O15269 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTLC1O15269 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTLC1O15269 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTLC1O15269 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTLC1O15269 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTLC1O15269 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTLC1O15269 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTLC1O15269 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTLC1O15269 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTLC1O15269 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPTLC1O15269 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPTLC1O15269 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPTLC1O15269 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPTLC1O15269 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPTLC1O15269 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPTLC1O15269 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SPTLC1O15269 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPTLC1O15269 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPTLC1O15269 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPTLC1O15269 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPTLC1O15269 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SPTLC1O15269 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPTLC1O15269 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPTLC1O15269 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPTLC1O15269 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPTLC1O15269 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPTLC1O15269 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPTLC1O15269 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPTLC1O15269 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPTLC1O15269 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SPTLC1O15269 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPTLC1O15269 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SPTLC1O15269 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTLC1O15269 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTLC1O15269 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTLC1O15269 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTLC1O15269 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTLC1O15269 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTLC1O15269 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTLC1O15269 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPTLC1O15269 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPTLC1O15269 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPTLC1O15269 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SPTLC1O15269 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPTLC1O15269 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPTLC1O15269 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPTLC1O15269 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPTLC1O15269 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPTLC1O15269 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPTLC1O15269 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPTLC1O15269 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPTLC1O15269 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPTLC1O15269 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPTLC1O15269 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPTLC1O15269 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPTLC1O15269 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPTLC1O15269 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPTLC1O15269 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPTLC1O15269 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPTLC1O15269 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPTLC1O15269 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPTLC1O15269 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPTLC1O15269 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPTLC1O15269 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPTLC1O15269 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPTLC1O15269 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPTLC1O15269 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SPTLC1O15269 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPTLC1O15269 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPTLC1O15269 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPTLC1O15269 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPTLC1O15269 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPTLC1O15269 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPTLC1O15269 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPTLC1O15269 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPTLC1O15269 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SPTLC1O15269 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPTLC1O15269 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPTLC1O15269 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPTLC1O15269 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPTLC1O15269 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPTLC1O15269 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPTLC1O15269 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPTLC1O15269 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPTLC1O15269 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPTLC1O15269 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPTLC1O15269 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPTLC1O15269 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPTLC1O15269 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms