Protein–RNA interactions for Protein: O15146

MUSK, Muscle, skeletal receptor tyrosine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUSKO15146 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MUSKO15146 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MUSKO15146 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MUSKO15146 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MUSKO15146 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MUSKO15146 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MUSKO15146 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MUSKO15146 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MUSKO15146 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MUSKO15146 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MUSKO15146 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MUSKO15146 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MUSKO15146 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MUSKO15146 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MUSKO15146 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MUSKO15146 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MUSKO15146 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MUSKO15146 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MUSKO15146 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MUSKO15146 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MUSKO15146 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MUSKO15146 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MUSKO15146 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MUSKO15146 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MUSKO15146 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MUSKO15146 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MUSKO15146 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MUSKO15146 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MUSKO15146 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MUSKO15146 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MUSKO15146 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MUSKO15146 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MUSKO15146 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MUSKO15146 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MUSKO15146 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MUSKO15146 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MUSKO15146 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MUSKO15146 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MUSKO15146 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MUSKO15146 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MUSKO15146 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MUSKO15146 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MUSKO15146 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MUSKO15146 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MUSKO15146 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MUSKO15146 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MUSKO15146 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MUSKO15146 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MUSKO15146 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MUSKO15146 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MUSKO15146 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MUSKO15146 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MUSKO15146 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MUSKO15146 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MUSKO15146 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MUSKO15146 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MUSKO15146 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MUSKO15146 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MUSKO15146 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MUSKO15146 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MUSKO15146 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MUSKO15146 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MUSKO15146 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MUSKO15146 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MUSKO15146 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MUSKO15146 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MUSKO15146 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MUSKO15146 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MUSKO15146 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MUSKO15146 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MUSKO15146 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MUSKO15146 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MUSKO15146 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MUSKO15146 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MUSKO15146 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MUSKO15146 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MUSKO15146 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUSKO15146 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUSKO15146 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUSKO15146 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUSKO15146 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUSKO15146 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUSKO15146 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUSKO15146 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MUSKO15146 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MUSKO15146 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MUSKO15146 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MUSKO15146 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MUSKO15146 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MUSKO15146 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MUSKO15146 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MUSKO15146 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MUSKO15146 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MUSKO15146 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MUSKO15146 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MUSKO15146 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MUSKO15146 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MUSKO15146 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MUSKO15146 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MUSKO15146 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms