Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCF2LO15068 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCF2LO15068 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCF2LO15068 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCF2LO15068 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCF2LO15068 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCF2LO15068 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCF2LO15068 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCF2LO15068 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCF2LO15068 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCF2LO15068 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MCF2LO15068 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MCF2LO15068 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCF2LO15068 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCF2LO15068 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCF2LO15068 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCF2LO15068 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCF2LO15068 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCF2LO15068 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCF2LO15068 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCF2LO15068 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCF2LO15068 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCF2LO15068 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCF2LO15068 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MCF2LO15068 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCF2LO15068 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCF2LO15068 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCF2LO15068 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCF2LO15068 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCF2LO15068 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCF2LO15068 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCF2LO15068 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCF2LO15068 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCF2LO15068 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCF2LO15068 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCF2LO15068 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCF2LO15068 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCF2LO15068 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCF2LO15068 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCF2LO15068 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCF2LO15068 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCF2LO15068 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCF2LO15068 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCF2LO15068 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCF2LO15068 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCF2LO15068 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCF2LO15068 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCF2LO15068 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCF2LO15068 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCF2LO15068 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCF2LO15068 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCF2LO15068 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCF2LO15068 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms