Protein–RNA interactions for Protein: O00562

PITPNM1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM1O00562 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PITPNM1O00562 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PITPNM1O00562 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PITPNM1O00562 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PITPNM1O00562 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PITPNM1O00562 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PITPNM1O00562 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PITPNM1O00562 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PITPNM1O00562 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PITPNM1O00562 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PITPNM1O00562 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PITPNM1O00562 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PITPNM1O00562 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PITPNM1O00562 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PITPNM1O00562 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PITPNM1O00562 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PITPNM1O00562 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PITPNM1O00562 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PITPNM1O00562 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PITPNM1O00562 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PITPNM1O00562 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PITPNM1O00562 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PITPNM1O00562 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PITPNM1O00562 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PITPNM1O00562 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PITPNM1O00562 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PITPNM1O00562 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PITPNM1O00562 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PITPNM1O00562 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PITPNM1O00562 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PITPNM1O00562 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PITPNM1O00562 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PITPNM1O00562 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PITPNM1O00562 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PITPNM1O00562 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PITPNM1O00562 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PITPNM1O00562 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PITPNM1O00562 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PITPNM1O00562 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PITPNM1O00562 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PITPNM1O00562 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PITPNM1O00562 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PITPNM1O00562 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PITPNM1O00562 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PITPNM1O00562 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PITPNM1O00562 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PITPNM1O00562 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PITPNM1O00562 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PITPNM1O00562 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PITPNM1O00562 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PITPNM1O00562 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PITPNM1O00562 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PITPNM1O00562 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PITPNM1O00562 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PITPNM1O00562 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PITPNM1O00562 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PITPNM1O00562 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PITPNM1O00562 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PITPNM1O00562 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PITPNM1O00562 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PITPNM1O00562 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PITPNM1O00562 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PITPNM1O00562 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PITPNM1O00562 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PITPNM1O00562 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PITPNM1O00562 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PITPNM1O00562 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PITPNM1O00562 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PITPNM1O00562 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms