Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KPNA3O00505 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KPNA3O00505 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KPNA3O00505 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KPNA3O00505 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KPNA3O00505 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KPNA3O00505 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KPNA3O00505 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KPNA3O00505 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KPNA3O00505 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KPNA3O00505 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KPNA3O00505 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KPNA3O00505 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KPNA3O00505 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KPNA3O00505 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KPNA3O00505 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KPNA3O00505 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KPNA3O00505 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KPNA3O00505 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KPNA3O00505 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KPNA3O00505 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KPNA3O00505 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KPNA3O00505 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KPNA3O00505 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KPNA3O00505 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KPNA3O00505 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KPNA3O00505 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KPNA3O00505 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KPNA3O00505 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KPNA3O00505 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KPNA3O00505 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KPNA3O00505 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KPNA3O00505 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KPNA3O00505 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KPNA3O00505 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KPNA3O00505 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KPNA3O00505 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KPNA3O00505 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KPNA3O00505 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KPNA3O00505 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KPNA3O00505 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KPNA3O00505 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KPNA3O00505 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KPNA3O00505 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KPNA3O00505 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KPNA3O00505 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KPNA3O00505 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KPNA3O00505 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KPNA3O00505 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KPNA3O00505 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KPNA3O00505 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KPNA3O00505 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KPNA3O00505 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KPNA3O00505 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KPNA3O00505 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KPNA3O00505 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KPNA3O00505 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KPNA3O00505 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KPNA3O00505 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KPNA3O00505 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KPNA3O00505 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KPNA3O00505 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KPNA3O00505 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KPNA3O00505 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KPNA3O00505 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KPNA3O00505 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KPNA3O00505 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KPNA3O00505 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KPNA3O00505 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KPNA3O00505 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KPNA3O00505 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KPNA3O00505 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KPNA3O00505 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KPNA3O00505 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KPNA3O00505 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KPNA3O00505 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KPNA3O00505 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KPNA3O00505 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KPNA3O00505 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KPNA3O00505 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KPNA3O00505 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KPNA3O00505 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KPNA3O00505 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KPNA3O00505 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KPNA3O00505 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KPNA3O00505 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KPNA3O00505 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KPNA3O00505 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KPNA3O00505 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KPNA3O00505 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KPNA3O00505 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KPNA3O00505 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KPNA3O00505 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KPNA3O00505 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KPNA3O00505 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KPNA3O00505 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KPNA3O00505 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KPNA3O00505 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KPNA3O00505 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KPNA3O00505 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms