Protein–RNA interactions for Protein: O00299

CLIC1, Chloride intracellular channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC1O00299 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLIC1O00299 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIC1O00299 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIC1O00299 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIC1O00299 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIC1O00299 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIC1O00299 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIC1O00299 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIC1O00299 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIC1O00299 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIC1O00299 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLIC1O00299 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIC1O00299 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIC1O00299 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIC1O00299 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIC1O00299 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLIC1O00299 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIC1O00299 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIC1O00299 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIC1O00299 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLIC1O00299 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLIC1O00299 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLIC1O00299 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLIC1O00299 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLIC1O00299 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLIC1O00299 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLIC1O00299 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLIC1O00299 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CLIC1O00299 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLIC1O00299 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLIC1O00299 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CLIC1O00299 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms