Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HIP1O00291 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HIP1O00291 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HIP1O00291 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HIP1O00291 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HIP1O00291 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HIP1O00291 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
HIP1O00291 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HIP1O00291 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HIP1O00291 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HIP1O00291 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HIP1O00291 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
HIP1O00291 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HIP1O00291 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
HIP1O00291 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HIP1O00291 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HIP1O00291 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HIP1O00291 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HIP1O00291 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HIP1O00291 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HIP1O00291 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HIP1O00291 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HIP1O00291 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HIP1O00291 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HIP1O00291 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HIP1O00291 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HIP1O00291 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HIP1O00291 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HIP1O00291 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
HIP1O00291 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HIP1O00291 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HIP1O00291 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HIP1O00291 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HIP1O00291 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HIP1O00291 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HIP1O00291 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HIP1O00291 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HIP1O00291 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HIP1O00291 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HIP1O00291 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HIP1O00291 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HIP1O00291 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HIP1O00291 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HIP1O00291 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HIP1O00291 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HIP1O00291 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HIP1O00291 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HIP1O00291 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HIP1O00291 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HIP1O00291 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HIP1O00291 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HIP1O00291 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HIP1O00291 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HIP1O00291 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HIP1O00291 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HIP1O00291 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
HIP1O00291 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HIP1O00291 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HIP1O00291 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HIP1O00291 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HIP1O00291 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HIP1O00291 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HIP1O00291 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HIP1O00291 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HIP1O00291 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HIP1O00291 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HIP1O00291 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HIP1O00291 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HIP1O00291 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HIP1O00291 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HIP1O00291 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HIP1O00291 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
HIP1O00291 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HIP1O00291 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HIP1O00291 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HIP1O00291 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HIP1O00291 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HIP1O00291 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
HIP1O00291 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HIP1O00291 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HIP1O00291 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HIP1O00291 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HIP1O00291 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HIP1O00291 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HIP1O00291 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HIP1O00291 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HIP1O00291 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HIP1O00291 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HIP1O00291 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HIP1O00291 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HIP1O00291 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HIP1O00291 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
HIP1O00291 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HIP1O00291 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HIP1O00291 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HIP1O00291 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HIP1O00291 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HIP1O00291 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HIP1O00291 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HIP1O00291 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms