Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CROCC2H7BZ55 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CROCC2H7BZ55 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CROCC2H7BZ55 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CROCC2H7BZ55 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CROCC2H7BZ55 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.65
CROCC2H7BZ55 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CROCC2H7BZ55 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CROCC2H7BZ55 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CROCC2H7BZ55 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CROCC2H7BZ55 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CROCC2H7BZ55 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
CROCC2H7BZ55 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CROCC2H7BZ55 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CROCC2H7BZ55 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CROCC2H7BZ55 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CROCC2H7BZ55 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CROCC2H7BZ55 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CROCC2H7BZ55 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CROCC2H7BZ55 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CROCC2H7BZ55 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CROCC2H7BZ55 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CROCC2H7BZ55 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CROCC2H7BZ55 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CROCC2H7BZ55 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CROCC2H7BZ55 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
CROCC2H7BZ55 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CROCC2H7BZ55 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CROCC2H7BZ55 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CROCC2H7BZ55 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CROCC2H7BZ55 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
CROCC2H7BZ55 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CROCC2H7BZ55 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CROCC2H7BZ55 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CROCC2H7BZ55 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CROCC2H7BZ55 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CROCC2H7BZ55 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
CROCC2H7BZ55 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CROCC2H7BZ55 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CROCC2H7BZ55 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CROCC2H7BZ55 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CROCC2H7BZ55 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CROCC2H7BZ55 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
CROCC2H7BZ55 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
CROCC2H7BZ55 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CROCC2H7BZ55 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CROCC2H7BZ55 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CROCC2H7BZ55 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CROCC2H7BZ55 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CROCC2H7BZ55 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CROCC2H7BZ55 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
CROCC2H7BZ55 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CROCC2H7BZ55 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CROCC2H7BZ55 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
CROCC2H7BZ55 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CROCC2H7BZ55 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CROCC2H7BZ55 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
CROCC2H7BZ55 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CROCC2H7BZ55 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
CROCC2H7BZ55 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CROCC2H7BZ55 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CROCC2H7BZ55 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CROCC2H7BZ55 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CROCC2H7BZ55 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CROCC2H7BZ55 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CROCC2H7BZ55 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CROCC2H7BZ55 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CROCC2H7BZ55 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
CROCC2H7BZ55 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CROCC2H7BZ55 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CROCC2H7BZ55 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CROCC2H7BZ55 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CROCC2H7BZ55 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CROCC2H7BZ55 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CROCC2H7BZ55 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CROCC2H7BZ55 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
CROCC2H7BZ55 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CROCC2H7BZ55 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CROCC2H7BZ55 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CROCC2H7BZ55 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CROCC2H7BZ55 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC37.57■■■■□ 3.61
CROCC2H7BZ55 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
CROCC2H7BZ55 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CROCC2H7BZ55 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CROCC2H7BZ55 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CROCC2H7BZ55 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CROCC2H7BZ55 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
CROCC2H7BZ55 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CROCC2H7BZ55 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CROCC2H7BZ55 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
CROCC2H7BZ55 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CROCC2H7BZ55 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CROCC2H7BZ55 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CROCC2H7BZ55 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CROCC2H7BZ55 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CROCC2H7BZ55 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CROCC2H7BZ55 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CROCC2H7BZ55 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CROCC2H7BZ55 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CROCC2H7BZ55 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms