Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO7DNF2Z398 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMO7DNF2Z398 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO7DNF2Z398 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO7DNF2Z398 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7DNF2Z398 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7DNF2Z398 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7DNF2Z398 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7DNF2Z398 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7DNF2Z398 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMO7DNF2Z398 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMO7DNF2Z398 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMO7DNF2Z398 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMO7DNF2Z398 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO7DNF2Z398 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO7DNF2Z398 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO7DNF2Z398 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO7DNF2Z398 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO7DNF2Z398 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO7DNF2Z398 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO7DNF2Z398 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO7DNF2Z398 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMO7DNF2Z398 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO7DNF2Z398 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO7DNF2Z398 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO7DNF2Z398 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO7DNF2Z398 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMO7DNF2Z398 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7DNF2Z398 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7DNF2Z398 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7DNF2Z398 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO7DNF2Z398 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO7DNF2Z398 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO7DNF2Z398 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO7DNF2Z398 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO7DNF2Z398 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO7DNF2Z398 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO7DNF2Z398 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.8 ms